روزگار صائب بود. نظریۀ معاد جسمانی ملاصدرا که قائل به انگیختن بدن عنصری با قیافۀ این جهانی بود مورد نقد و اعتراض بسیاری از مخالفانش قرار گرفت. ملاصدرا به دلیل نظریات انقلابی‌اش مثل حدوث جسمانی روح، اصالت وجود، معاد جسمانی و دیگر ابتکارات فلسفی‌اش 15 سال به انزوا رفت